De gitarist groeide op te midden van grote flamencogitaristen, waaronder zijn vader en grootvader, beide Tomate genoemd, en zijn oom Niño Miguel. Al op jonge leeftijd was Tomatito (letterlijk tomaatje, naar zijn vader en grootvader) een sensatie. Zijn eerste publieke optreden onder de naam Pepín Fernández was op tienjarige leeftijd in de pena van Almería, waar hij optrad als begeleider. Sindsdien was hij daar met grote regelmaat te bewonderen. Na de verhuizing van zijn familie naar Málaga in 1970, wist vader El Tomate een vaste plaats voor hem te krijgen in het cuadro flamenco van de Taberna Gitana in Marbella. Naast het begeleiden van zangers en dansers speelde hij solostukken van Paco de Lucía. In die tijd begeleidde Tomatito vele grote namen, waaronder Pansequito en Lebrijano, en Paco de Lucía zelf. De legendarische cantaor (zanger) Cameron de la Isla bezocht deze taverna veel. Tijdens een festival in 1973 vroeg Camaron hem te begeleiden. Hier begon een 18-jarige samenwerking tussen twee kunstenaars, die tot de dood van Camaron in 1992 duurde. Samen hadden ze een hit (La leyenda del tiempo).
Tomatito is een graag geziene gast op vele internationale festivals als Montreux, New York en Balilea, het Internationale Muziek Festival van Istanbul, het gitaarfestival van Lyon en veel meer. Ook maakte hij tournees in onder andere Japan, Zwitserland,

Frankrijk en Duitsland
In zijn al lange loopbaan trad hij op met heel wat grootheden als Frank Sinatra, Elton John, Neneh Cherry en John McLaughlin. Zijn samenwerking met de pianist Michel Camilo leverde de cd´s ´Spain´ (2000) en ´Spain Again´ (2006) op.
De muziek van Tomatito is een bijzondere versmelting van traditionele flamenco en jazz in de beste traditie van de Flamenco Nuevo. Ook experimenteerde hij, bijvoorbeeld op het album ´Barrio Negro´, met Afro-Cubaanse en Braziliaanse muzieksoorten.
Beroemde ´flamencos´ die Tomatito zeer bewonderen zijn José Mercé en El Cigala maar ook de onlangs overleden Enrique Morente was een groot bewonderaar. Internationale muzikanten die hem op hun beurt beïnvloeden zijn George Benson, Miles Davis, Charlie Parker maar ook de blues en rock latino artiesten Santana, BB King en Eric Clapton. Deze invloeden zijn onmiskenbaar te horen in Tomatito´s muziek.

Wie de kans heeft Tomatito te bewonderen, zal dit nimmer vergeten. Flamenco muziek in zijn puurste vorm, gelardeerd met jazz, latino en rock.
Op Primavera 2012 presenteert Tomatito een uniek flamenco dans en zang project: Duende in the Blood.